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Das gemeinsame Ziel von MICROBE und dem DFG Schwerpunktprogramm „Biodiversitäts-Exploratorien“ ist die Erfassung mikrobieller Diversität in Böden. In den Exploratorien wurden bis dato primär molekulare Verfahren genutzt um das Bodenmikrobiom in seiner Struktur und Funktion zu charakterisieren. Im Rahmen des EU-Projektes MICROBE sollen nun komplementär auch die entsprechenden Schlüsselmikroorganismen isoliert und kultiviert werden, um sie danach in Stammsammlungen (z.B. DSMZ) zu lagern und der Allgemeinheit zur Verfügung zu stellen.


Es sollen Daten zu folgenden Parametern erfasst werden:

  • Isolierung von Schlüsselmikroorganismen aus den Bodenproben die im Rahmen der General Soil Sampling Campaign genommen werden.
  • Isolierung von Nukleinsäuren (gDNA und RNA) um die Lagerungsstabilität der Proben zu untersuchen.
  • Die Definition der entsprechenden Schlüsselorganismen erfolgt an Hand der molekularen Barcoding Daten für Bakterien und Pilze aus den Jahren 2006 ff.

Kooperationen sind aus eigenen Mitteln der Kooperationspartner finanzierte Projekte und damit finanziell unabhängig von dem DFG-finanzierten Infrastruktur-Schwerpunktprogramm „Biodiversitäts-Exploratorien (BE)“. Sie ergänzen die BE um weitere interessante Forschungsinhalte zur Biodiversitätsforschung und profitieren im Gegenzug von der Infrastruktur der Biodiversitäts-Exploratorien.

Wissenschaftliche Mitarbeiter:innen

Prof. Dr. Michael Schloter
Projektleiter
Prof. Dr. Michael Schloter
Technische Universität München (TUM)
Prof. Dr. Jörg Overmann
Projektleiter
Prof. Dr. Jörg Overmann
Leibniz-Institut DSMZ - Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen
Dr. Pamela Espíndola Hernández
Mitarbeiterin
Dr. Pamela Espíndola Hernández
Helmholtz Zentrum München
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